Showing Protein DNA ligase 3 (CDBP00574)
| Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HMDB Protein ID | CDBP00574 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary Accession Numbers | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name | DNA ligase 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Name | LIG3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Type | Enzyme | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General Function | Involved in DNA ligase (ATP) activity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specific Function | Interacts with DNA-repair protein XRCC1 and can correct defective DNA strand-break repair and sister chromatid exchange following treatment with ionizing radiation and alkylating agents. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO Classification |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Location |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chromosome Location | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Locus | 17q11.2-q12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNPs | LIG3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Sequence |
>3030 bp ATGTCTTTGGCTTTCAAGATCTTCTTTCCACAAACCCTCCGTGCACTCAGCCGAAAAGAA CTGTGCCTATTCCGAAAACATCACTGGCGTGATGTAAGACAATTCAGCCAGTGGTCAGAA ACAGATCTGCTTCATGGACATCCCCTCTTCCTGAGAAGAAAGCCTGTTCTATCATTCCAG GGAAGCCATCTAAGATCACGTGCCACCTACCTTGTTTTCTTGCCAGGGTTGCATGTGGGA CTCTGCAGTGGCCCCTGTGAGATGGCTGAGCAACGGTTCTGTGTGGACTATGCCAAGCGT GGCACAGCTGGCTGCAAAAAATGCAAGGAAAAGATTGTGAAGGGCGTATGCCGAATTGGC AAAGTGGTGCCCAATCCCTTCTCAGAGTCTGGGGGTGATATGAAAGAGTGGTACCACATT AAATGCATGTTTGAGAAACTAGAGCGGGCCCGGGCCACCACAAAAAAAATCGAGGACCTC ACAGAGCTGGAAGGCTGGGAAGAGCTGGAAGATAATGAGAAGGAACAGATAACCCAGCAC ATTGCAGATCTGTCTTCTAAGGCAGCAGGTACACCAAAGAAGAAAGCTGTTGTCCAGGCT AAGTTGACAACCACTGGCCAGGTGACTTCTCCAGTGAAAGGCGCCTCATTTGTCACCAGT ACCAATCCCCGGAAATTTTCTGGCTTTTCAGCCAAGCCCAACAACTCTGGGGAAGCCCCC TCGAGCCCCACCCCTAAGAGAAGTCTGTCTTCAAGCAAATGTGACCCCAGGCATAAGGAC TGTCTGCTACGGGAGTTTCGAAAGTTATGCGCCATGGTGGCCGATAATCCTAGCTACAAC ACGAAGACCCAGATCATCCAGGACTTCCTTCGGAAAGGCTCAGCAGGAGATGGTTTCCAC GGTGATGTGTACCTAACAGTGAAGCTGCTGCTGCCAGGAGTCATTAAGACTGTTTACAAC TTGAACGATAAGCAGATTGTGAAGCTTTTCAGTCGCATTTTTAACTGCAACCCAGATGAT ATGGCACGGGACCTAGAGCAGGGTGACGTGTCAGAGACAATCAGAGTCTTCTTTGAGCAG AGCAAGTCTTTCCCCCCAGCTGCCAAGAGCCTCCTTACCATCCAGGAAGTGGATGAGTTC CTTCTGCGGCTGTCCAAGCTCACCAAGGAGGATGAGCAGCAACAGGCCCTACAGGACATT GCCTCCAGGTGTACAGCCAATGACCTTAAATGCATCATCAGGTTGATCAAACATGATCTG AAGATGAACTCAGGTGCAAAACATGTGTTAGACGCCCTTGACCCCAATGCCTATGAAGCC TTCAAAGCCTCGCGCAACCTGCAGGATGTGGTGGAGCGGGTCCTTCACAACGCGCAGGAG GTGGAGAAGGAGCCGGGCCAGAGACGAGCTCTGAGCGTCCAGGCCTCGCTGATGACACCT GTGCAGCCCATGTTGGCGGAGGCCTGCAAGTCCGTTGAGTATGCAATGAAGAAATGTCCC AATGGCATGTTCTCTGAGATCAAGTACGATGGAGAGCGAGTCCAGGTGCATAAGAATGGA GACCACTTCAGCTACTTCAGCCGCAGTCTCAAGCCCGTCCTTCCTCACAAGGTGGCCCAC TTTAAGGACTACATTCCCCAGGCTTTTCCTGGGGGCCACAGCATGATCTTGGATTCTGAA GTGCTTCTGATTGACAACAAGACAGGCAAACCACTGCCCTTTGGGACTCTGGGAGTACAC AAGAAAGCAGCCTTCCAGGATGCTAATGTCTGCCTGTTTGTTTTTGATTGTATCTACTTT AATGATGTCAGCTTGATGGACAGACCTCTGTGTGAGCGGCGGAAGTTTCTTCATGACAAC ATGGTTGAAATTCCAAACCGGATCATGTTCTCAGAAATGAAGCGAGTCACAAAAGCTTTG GACTTGGCTGACATGATAACCCGGGTGATCCAGGAGGGATTGGAGGGGCTGGTGCTGAAG GATGTGAAGGGTACATATGAGCCTGGGAAGCGGCACTGGCTGAAAGTGAAGAAAGACTAT TTGAACGAGGGGGCCATGGCCGACACAGCTGACCTGGTGGTCCTTGGAGCCTTCTATGGG CAAGGGAGCAAAGGCGGCATGATGTCAATCTTCCTCATGGGCTGCTACGACCCTGGCAGC CAGAAGTGGTGCACAGTCACCAAGTGTGCAGGAGGCCATGATGATGCCACGCTTGCCCGC CTGCAGAATGAACTAGACATGGTGAAGATCAGCAAGGACCCCAGCAAAATACCCAGCTGG TTGAAGGTCAACAAGATCTACTATCCTGACTTCATCGTCCCAGACCCAAAGAAAGCTGCC GTGTGGGAGATCACAGGGGCTGAATTCTCCAAATCGGAGGCTCATACAGCTGACGGGATC TCCATCCGATTCCCTCGCTGCACCCGAATCCGAGATGATAAGGACTGGAAATCTGCCACT AACCTTCCCCAACTCAAGGAACTGTACCAGTTGTCCAAGGAGAAGGCAGACTTCACTGTA GTGGCTGGAGATGAGGGGAGCTCCACTACAGGGGGTAGCAGTGAAGAGAATAAGGGTCCC TCAGGGTCTGCTGTGTCCCGCAAGGCCCCCAGCAAGCCCTCAGCCAGTACCAAGAAAGCA GAAGGGAAGCTGAGTAACTCCAACAGCAAAGATGGCAACATGCAGACTGCAAAGCCTTCC GCTATGAAGGTGGGGGAGAAGCTGGCCACAAAGTCTTCTCCAGTGAAAGTAGGGGAGAAG CGGAAAGCTGCTGATGAGACGCTGTGCCAAACAAAGGTATTGCTGGACATCTTCACTGGG GTGCGGCTTTACTTGCCACCCTCCACACCAGACTTCAGCCGTCTCAGACGCTACTTTGTG GCATTCGACGGGGACCTGGTACAGGAATTTGATATGACTTCAGCCACGCACGTGCTGGGT AGCAGGGACAAGAACCCTGCGGCCCAGCAGGTCTCCCCAGAGTGGATTTGGGCATGTATC CGGAAACGGAGACTGGTAGCTCCCTGCTAG |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number of Residues | 1009 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight | 106017.03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Theoretical pI | 9.152 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam Domain Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Signals | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane Regions | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Sequence |
>DNA ligase 3 MSLAFKIFFPQTLRALSRKELCLFRKHHWRDVRQFSQWSETDLLHGHPLFLRRKPVLSFQ GSHLRSRATYLVFLPGLHVGLCSGPCEMAEQRFCVDYAKRGTAGCKKCKEKIVKGVCRIG KVVPNPFSESGGDMKEWYHIKCMFEKLERARATTKKIEDLTELEGWEELEDNEKEQITQH IADLSSKAAGTPKKKAVVQAKLTTTGQVTSPVKGASFVTSTNPRKFSGFSAKPNNSGEAP SSPTPKRSLSSSKCDPRHKDCLLREFRKLCAMVADNPSYNTKTQIIQDFLRKGSAGDGFH GDVYLTVKLLLPGVIKTVYNLNDKQIVKLFSRIFNCNPDDMARDLEQGDVSETIRVFFEQ SKSFPPAAKSLLTIQEVDEFLLRLSKLTKEDEQQQALQDIASRCTANDLKCIIRLIKHDL KMNSGAKHVLDALDPNAYEAFKASRNLQDVVERVLHNAQEVEKEPGQRRALSVQASLMTP VQPMLAEACKSVEYAMKKCPNGMFSEIKYDGERVQVHKNGDHFSYFSRSLKPVLPHKVAH FKDYIPQAFPGGHSMILDSEVLLIDNKTGKPLPFGTLGVHKKAAFQDANVCLFVFDCIYF NDVSLMDRPLCERRKFLHDNMVEIPNRIMFSEMKRVTKALDLADMITRVIQEGLEGLVLK DVKGTYEPGKRHWLKVKKDYLNEGAMADTADLVVLGAFYGQGSKGGMMSIFLMGCYDPGS QKWCTVTKCAGGHDDATLARLQNELDMVKISKDPSKIPSWLKVNKIYYPDFIVPDPKKAA VWEITGAEFSKSEAHTADGISIRFPRCTRIRDDKDWKSATNLPQLKELYQLSKEKADFTV VAGDEGSSTTGGSSEENKGPSGSAVSRKAPSKPSASTKKAEGKLSNSNSKDGNMQTAKPS AMKVGEKLATKSSPVKVGEKRKAADETLCQTKVLLDIFTGVRLYLPPSTPDFSRLRRYFV AFDGDLVQEFDMTSATHVLGSRDKNPAAQQVSPEWIWACIRKRRLVAPC |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenBank ID Protein | 73747829 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProtKB/Swiss-Prot ID | P49916 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProtKB/Swiss-Prot Entry Name | DNLI3_HUMAN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenBank Gene ID | NM_013975.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCard ID | LIG3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas ID | LIG3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC ID | HGNC:6600 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
