Showing Protein DNA ligase 3 (CDBP00574)
Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
HMDB Protein ID | CDBP00574 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name | DNA ligase 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | LIG3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Type | Enzyme | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General Function | Involved in DNA ligase (ATP) activity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Specific Function | Interacts with DNA-repair protein XRCC1 and can correct defective DNA strand-break repair and sister chromatid exchange following treatment with ionizing radiation and alkylating agents. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GO Classification |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Location |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome Location | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Locus | 17q11.2-q12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs | LIG3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Sequence |
>3030 bp ATGTCTTTGGCTTTCAAGATCTTCTTTCCACAAACCCTCCGTGCACTCAGCCGAAAAGAA CTGTGCCTATTCCGAAAACATCACTGGCGTGATGTAAGACAATTCAGCCAGTGGTCAGAA ACAGATCTGCTTCATGGACATCCCCTCTTCCTGAGAAGAAAGCCTGTTCTATCATTCCAG GGAAGCCATCTAAGATCACGTGCCACCTACCTTGTTTTCTTGCCAGGGTTGCATGTGGGA CTCTGCAGTGGCCCCTGTGAGATGGCTGAGCAACGGTTCTGTGTGGACTATGCCAAGCGT GGCACAGCTGGCTGCAAAAAATGCAAGGAAAAGATTGTGAAGGGCGTATGCCGAATTGGC AAAGTGGTGCCCAATCCCTTCTCAGAGTCTGGGGGTGATATGAAAGAGTGGTACCACATT AAATGCATGTTTGAGAAACTAGAGCGGGCCCGGGCCACCACAAAAAAAATCGAGGACCTC ACAGAGCTGGAAGGCTGGGAAGAGCTGGAAGATAATGAGAAGGAACAGATAACCCAGCAC ATTGCAGATCTGTCTTCTAAGGCAGCAGGTACACCAAAGAAGAAAGCTGTTGTCCAGGCT AAGTTGACAACCACTGGCCAGGTGACTTCTCCAGTGAAAGGCGCCTCATTTGTCACCAGT ACCAATCCCCGGAAATTTTCTGGCTTTTCAGCCAAGCCCAACAACTCTGGGGAAGCCCCC TCGAGCCCCACCCCTAAGAGAAGTCTGTCTTCAAGCAAATGTGACCCCAGGCATAAGGAC TGTCTGCTACGGGAGTTTCGAAAGTTATGCGCCATGGTGGCCGATAATCCTAGCTACAAC ACGAAGACCCAGATCATCCAGGACTTCCTTCGGAAAGGCTCAGCAGGAGATGGTTTCCAC GGTGATGTGTACCTAACAGTGAAGCTGCTGCTGCCAGGAGTCATTAAGACTGTTTACAAC TTGAACGATAAGCAGATTGTGAAGCTTTTCAGTCGCATTTTTAACTGCAACCCAGATGAT ATGGCACGGGACCTAGAGCAGGGTGACGTGTCAGAGACAATCAGAGTCTTCTTTGAGCAG AGCAAGTCTTTCCCCCCAGCTGCCAAGAGCCTCCTTACCATCCAGGAAGTGGATGAGTTC CTTCTGCGGCTGTCCAAGCTCACCAAGGAGGATGAGCAGCAACAGGCCCTACAGGACATT GCCTCCAGGTGTACAGCCAATGACCTTAAATGCATCATCAGGTTGATCAAACATGATCTG AAGATGAACTCAGGTGCAAAACATGTGTTAGACGCCCTTGACCCCAATGCCTATGAAGCC TTCAAAGCCTCGCGCAACCTGCAGGATGTGGTGGAGCGGGTCCTTCACAACGCGCAGGAG GTGGAGAAGGAGCCGGGCCAGAGACGAGCTCTGAGCGTCCAGGCCTCGCTGATGACACCT GTGCAGCCCATGTTGGCGGAGGCCTGCAAGTCCGTTGAGTATGCAATGAAGAAATGTCCC AATGGCATGTTCTCTGAGATCAAGTACGATGGAGAGCGAGTCCAGGTGCATAAGAATGGA GACCACTTCAGCTACTTCAGCCGCAGTCTCAAGCCCGTCCTTCCTCACAAGGTGGCCCAC TTTAAGGACTACATTCCCCAGGCTTTTCCTGGGGGCCACAGCATGATCTTGGATTCTGAA GTGCTTCTGATTGACAACAAGACAGGCAAACCACTGCCCTTTGGGACTCTGGGAGTACAC AAGAAAGCAGCCTTCCAGGATGCTAATGTCTGCCTGTTTGTTTTTGATTGTATCTACTTT AATGATGTCAGCTTGATGGACAGACCTCTGTGTGAGCGGCGGAAGTTTCTTCATGACAAC ATGGTTGAAATTCCAAACCGGATCATGTTCTCAGAAATGAAGCGAGTCACAAAAGCTTTG GACTTGGCTGACATGATAACCCGGGTGATCCAGGAGGGATTGGAGGGGCTGGTGCTGAAG GATGTGAAGGGTACATATGAGCCTGGGAAGCGGCACTGGCTGAAAGTGAAGAAAGACTAT TTGAACGAGGGGGCCATGGCCGACACAGCTGACCTGGTGGTCCTTGGAGCCTTCTATGGG CAAGGGAGCAAAGGCGGCATGATGTCAATCTTCCTCATGGGCTGCTACGACCCTGGCAGC CAGAAGTGGTGCACAGTCACCAAGTGTGCAGGAGGCCATGATGATGCCACGCTTGCCCGC CTGCAGAATGAACTAGACATGGTGAAGATCAGCAAGGACCCCAGCAAAATACCCAGCTGG TTGAAGGTCAACAAGATCTACTATCCTGACTTCATCGTCCCAGACCCAAAGAAAGCTGCC GTGTGGGAGATCACAGGGGCTGAATTCTCCAAATCGGAGGCTCATACAGCTGACGGGATC TCCATCCGATTCCCTCGCTGCACCCGAATCCGAGATGATAAGGACTGGAAATCTGCCACT AACCTTCCCCAACTCAAGGAACTGTACCAGTTGTCCAAGGAGAAGGCAGACTTCACTGTA GTGGCTGGAGATGAGGGGAGCTCCACTACAGGGGGTAGCAGTGAAGAGAATAAGGGTCCC TCAGGGTCTGCTGTGTCCCGCAAGGCCCCCAGCAAGCCCTCAGCCAGTACCAAGAAAGCA GAAGGGAAGCTGAGTAACTCCAACAGCAAAGATGGCAACATGCAGACTGCAAAGCCTTCC GCTATGAAGGTGGGGGAGAAGCTGGCCACAAAGTCTTCTCCAGTGAAAGTAGGGGAGAAG CGGAAAGCTGCTGATGAGACGCTGTGCCAAACAAAGGTATTGCTGGACATCTTCACTGGG GTGCGGCTTTACTTGCCACCCTCCACACCAGACTTCAGCCGTCTCAGACGCTACTTTGTG GCATTCGACGGGGACCTGGTACAGGAATTTGATATGACTTCAGCCACGCACGTGCTGGGT AGCAGGGACAAGAACCCTGCGGCCCAGCAGGTCTCCCCAGAGTGGATTTGGGCATGTATC CGGAAACGGAGACTGGTAGCTCCCTGCTAG |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Residues | 1009 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight | 106017.03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Theoretical pI | 9.152 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam Domain Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Signals | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transmembrane Regions | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Sequence |
>DNA ligase 3 MSLAFKIFFPQTLRALSRKELCLFRKHHWRDVRQFSQWSETDLLHGHPLFLRRKPVLSFQ GSHLRSRATYLVFLPGLHVGLCSGPCEMAEQRFCVDYAKRGTAGCKKCKEKIVKGVCRIG KVVPNPFSESGGDMKEWYHIKCMFEKLERARATTKKIEDLTELEGWEELEDNEKEQITQH IADLSSKAAGTPKKKAVVQAKLTTTGQVTSPVKGASFVTSTNPRKFSGFSAKPNNSGEAP SSPTPKRSLSSSKCDPRHKDCLLREFRKLCAMVADNPSYNTKTQIIQDFLRKGSAGDGFH GDVYLTVKLLLPGVIKTVYNLNDKQIVKLFSRIFNCNPDDMARDLEQGDVSETIRVFFEQ SKSFPPAAKSLLTIQEVDEFLLRLSKLTKEDEQQQALQDIASRCTANDLKCIIRLIKHDL KMNSGAKHVLDALDPNAYEAFKASRNLQDVVERVLHNAQEVEKEPGQRRALSVQASLMTP VQPMLAEACKSVEYAMKKCPNGMFSEIKYDGERVQVHKNGDHFSYFSRSLKPVLPHKVAH FKDYIPQAFPGGHSMILDSEVLLIDNKTGKPLPFGTLGVHKKAAFQDANVCLFVFDCIYF NDVSLMDRPLCERRKFLHDNMVEIPNRIMFSEMKRVTKALDLADMITRVIQEGLEGLVLK DVKGTYEPGKRHWLKVKKDYLNEGAMADTADLVVLGAFYGQGSKGGMMSIFLMGCYDPGS QKWCTVTKCAGGHDDATLARLQNELDMVKISKDPSKIPSWLKVNKIYYPDFIVPDPKKAA VWEITGAEFSKSEAHTADGISIRFPRCTRIRDDKDWKSATNLPQLKELYQLSKEKADFTV VAGDEGSSTTGGSSEENKGPSGSAVSRKAPSKPSASTKKAEGKLSNSNSKDGNMQTAKPS AMKVGEKLATKSSPVKVGEKRKAADETLCQTKVLLDIFTGVRLYLPPSTPDFSRLRRYFV AFDGDLVQEFDMTSATHVLGSRDKNPAAQQVSPEWIWACIRKRRLVAPC |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenBank ID Protein | 73747829 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProtKB/Swiss-Prot ID | P49916 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProtKB/Swiss-Prot Entry Name | DNLI3_HUMAN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenBank Gene ID | NM_013975.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GeneCard ID | LIG3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenAtlas ID | LIG3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC ID | HGNC:6600 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References | Not Available |